明洪武四年（1371），祝氏从山西迁此定居，因庄小人稀，得名小祝庄。后更名为南祝庄。
2023年9月，南祝庄村被确定为河南省第一批乡村建设示范村。
2022年3月，南祝庄村被评选为2021年商丘市市级基层党建示范村。
南祝庄村：位于古王集乡以南1公里处。南祝庄村与官庄村、荣庄村、左窑村、潘小楼村、王集东村、潘耿庄村、王集西村相邻。历史沿革：1949年称南祝庄行政村，属贾寨区。
1956年称南祝庄高级农业生产合作社，属王集乡。
1958年称南祝庄生产大队，属王集人民公社。
1981年王集更名为古王集，属古王集人民公社。
1983年更名为南祝庄村民委员会，属古王集乡，沿用至今。
