清初，吴姓从今邓州市张村乡吴营村迁此，因住南北走向沟内，故名。
吴沟村是内乡县桃溪镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411325109200，居民身份证号码前6位为411325。邮政编码为473000，长途电话区号为377 ，车牌号码为豫R。吴沟村与石碑营村、桃溪村、桃庄河村、黑山村、东川村、大路村、寺河村、彭沟村相邻。历史沿革：民国期间属岞𪨰区吴沟保和岞𪨰保。
1956年属岞𪨰中心乡先锋高级社。
1958年成立石碑营大队，属岞𪨰公社。
1960年为岞𪨰公社吴沟大队。
1962年为西庙岗公社吴沟大队。
1984年改为吴沟村民委员会，属西庙岗乡。
2008年西庙岗乡改桃溪镇，属桃溪镇，沿用至今。
