东汉时期，在斜纹河边有座马王庙。后来在庙周围形成村落，故名马庙。
马庙村是汝阳县付店镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410326102202，居民身份证号码前6位为410326。邮政编码为471000，长途电话区号为379 ，车牌号码为豫C。马庙村与东沟村、拨菜村、银鹿村、付店村、松门村、牌路社区、火庙村、石柱村、苇元村、河庄村、太山村、后坪村、西坪村相邻。历史沿革：明清，为马庙镇，属上店里。
1912年，为马庙保，属龙崖镇。
1949年，为马庙乡，属付店区。
1960年，建立马庙大队，属付店公社。
1984年改为马庙村民委员会，属付店乡。
