北宋中叶齐姓由塘源（今梅港乡）迁此，因居一水圳之尾端，故名圳尾，后误为镇尾。
2023年3月，入选江西省“十四五”省定乡村振兴重点帮扶村名单。
镇尾村是余干县古埠镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为361127104218，居民身份证号码前6位为361127。邮政编码为335000，长途电话区号为793，车牌号码为赣E。镇尾村与干港村、邱家村、四一村、保安山村、蒋家村、童埠村、古山村、挂口村、联合村、象山村、黄岗寺村、古埠村、宁岗村、禁山村相邻。历史沿革：1949年前属古埠乡。
1958年属燎原公社，以高举三面红旗之义称红旗大队。
1983年以驻地更为镇尾大队。
1984年改为镇尾村民委员会，沿用至今。
