明代为莫源村，属三溪都，形容四周山峦重叠、森林茂密；漠源村，即村民于四周山峦重叠、森林茂密的地方定居形成的乡村。

漠源乡漠源村距县城14公里，9个村民小组，348户，总人口1376人，党支部现有党员52名，其中女党员5名。近年来党支部把创先争优活动与持续深化“三级联创”、“三向培养”、“设岗定责”等活动有机结合起来，认真实施了“168”党建工作模式，全面推行“六步工作法”和“四议两公开”制度。以创建“五个好”党支部、争做“五带头”优秀党员为目标，充分发挥村党支部领导核心等八个方面作用，把基层党组织建设成为推动科学发展、带领农民致富、密切联系群众、维护农村稳定的坚强领导核心。漠源先后荣获等荣誉称号。党支部从漠源实际出发，因地制宜，积极引导群众调整产业结构，大力发展竹业，建立以甲头200亩科技+查看详细漠源村概况>>

2024年7月，被命名为2023年度三明市达标“六无”村（社区）。

2024年7月，被确定为2021-2023年三明市达标“六无”村（社区）。

2022年10月，福建省农业农村厅认定漠源村定为第二批福建省乡村治理示范村镇。

2021年12月，漠源村被命名为2021年度福建省森林村庄。

历史沿革：1931年-1934年设漠源乡苏维埃政府，1949年称第一区民族乡漠源保，1950年解放初称第二区漠源乡，1950年认定为革命老区乡镇，1958年成立漠源大队，属城关红星公社，1961年-1984年9月属漠源乡下辖的大队，1984年9月改称村民委员会。