主要由头英石山、草湖山、后山仔山三个小山包组成（山丘为墩）。

三墩村概况本村由英石山、草湖山、后山仔三个小山色组成，故村得名三墩，宋、元属感德乡南匿里，明、清属四区南匿里，民国初归省府直辖，23年属福清县九区，24-25年属南日特种区，29年属莆田县南日镇，32年属南日镇三墩村，49年属13区三墩村，50年属13区三墩乡，52年属24区三墩乡，54年至55年属24区（南日）三墩乡，57年属南日镇三墩高级社，58年属南日公社三塘大社，84年改为南日镇三墩村委会。本村属草湖境青龙社、头英石境英石社、红头户境龙兴社。本村委会位于南日镇驻地东侧1.1公里，在海山西高村委会之间，村委会驻头英石自然村，辖草湖、后山仔、头英石、屿仔尾、半埔头户6个自然村，+查看详细三墩村概况>>

2022年12月，福建省爱国卫生运动委员会命名三墩村为2022年福建省卫生村。

2022年10月，福建省农业农村厅认定三墩村定为第二批福建省乡村治理示范村镇。

历史沿革：1943，属莆田县南日乡三墩村；中华人民共和国成立后，属莆田县十三区三墩村、三墩乡，二十四区三墩乡；1957年，改为莆田县南日乡三墩高级社；1958年，改为莆田县南日人民公社三塘大队；1984年，改为莆田县南日乡三墩村；1993年12月，南日乡改为南日镇，属莆田县南日镇；2002年2月，属秀屿区南日镇三墩村。