盧姓由漳州永定县迁来，故称南盧，后书写方便定今名。村委会以驻地村名命名。
2021年11月，福建省爱卫办命名南芦村为2021年福建省卫生村。
南芦村是福清市港头镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为350181108230，居民身份证号码前6位为350181。邮政编码为350300，长途电话区号为591，车牌号码为闽A。南芦村与陈库村、西芦村、后卓村、杭下村、占阳村、北湾村、湖山村、马湖村、玉田村、高东村、岭头村、五星村、光辉村、东光村相邻。历史沿革：宋属孝义乡，化南里，有泰溪、秦印两境。
清宣统二年（1910年）属高山镇。
1984年改大队为村委会，属港头乡。
