因境内有村庄深都，村西有河流流经，渡口水深，得名深渡，后属十六都时因“渡”与“都”谐音变为深都，且村委会驻地于此，故得名深都村村民委员会。

深都村座落于历口镇南侧，位于大青线旁，距祁门县县政府30公里，距历口镇9公里，处于牯牛降国家自然保护区和历溪风景区旅游线上，青山环抱，绿水绕流，空气湿润，生态极佳。现有人口729人，5个村民组，由深都自然村和淑里自然村组成，呈犄角之势分布。 深都村民风淳朴，风景秀丽。村内房屋多为二层以上徽派建筑，尤以一本堂祠堂和六间屋为主要代表。青砖黛瓦，马头墙和天井，与修竹、翠桃、银杏等树交汇成闲静的江南山村，环村的前山河和温柔的浣衣少女更加增添了山村的灵性。 深都村自古以来，尊师重教，人文气息浓厚。村内外出工作者众多。有从政、从商、从教及百业者不下百人，村口凤凰山和水口林见证了村人发展+查看详细深都村概况>>

2023年11月，被确定为2022年安徽省卫生村（社区）。

2023年4月，被评选为第五届祁门县文明村镇（社区）。

2021年3月，深都村被命名为第八批安徽省民主法治示范村（社区）。

2020年5月，深都村被命名为2019年度黄山市卫生镇村（社区）。

2019年12月，深都村入选2019年度安徽省森林村庄。

历史沿革：建国后属六区历龙乡；1951年属历口镇；1958年属历口管理区；1961年成立历口公社，为历口公社深都大队；1983年体制改革，为历口乡深都村；1989年历口乡改为历口镇，属之至今。