《临海陇洲章氏宗谱》载，（明末）“天下大乱，为避战乱，处士海游人章廷可携六子入山，惟恐不深，寻至陇洲结庐而居”。古名陇洲，因村地形四周高而中间低，取“一孔之坵”名孔坵，后谐音得名。

2020年12月，孔丘村被命名为2020年浙江省3A级景区村庄。

2013年8月，孔丘村被列入第二批中国传统村落名录。

孔丘村是临海市汇溪镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为331082103228，居民身份证号码前6位为331082。邮政编码为318000，长途电话区号为576 ，车牌号码为浙J。孔丘村与仙人桥村、江根村、天门村、山安村、联峰村、善家洋村、聚贤村、汇合村、龙溪村、龙隐村、西溪村、两头门村、牌前村、浚头村相邻。历史沿革：建国初称孔坵乡第五村；1958年称孔坵生产队，属仙人桥管理区；1961年称孔坵大队，属仙人桥人民公社；1981年称孔坵大队，属孔坵人民公社；1984年称孔坵村，属孔坵乡，1989年改属仙人桥乡；2002年改属汇溪镇。