由健跳分设，因村民主要从事农业生产，故名。
2022年1月，入选浙江省2021年度省级“民主法治村（社区）”名单。
2021年12月，健农村被命名为2021年浙江省卫生村。
健农村是三门县健跳镇下辖的行政村，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为331022105205，居民身份证号码前6位为331022。邮政编码为318000，长途电话区号为576 ，车牌号码为浙J。健农村与三良社区、健渔村、沿港社区、猫头村、健中社区、东边村、西边村、西郭村、上陈村、毛张村、毛叶村、岙口村、大塘村、小蒲村相邻。文化旅游：
健跳所城遗址健跳所城距三门县城20公里，东临三门湾海域。三门健跳所城地处海防要塞，历来受外国侵略者的垂涎和掠抢。名将俞大猷、戚继光、谭纶等先后在三门湾驻守抗倭，屡与倭寇鏖战于三门湾畔，威震海疆，留下许多戚继光去思碑戚继光去思碑位于三门县健跳镇健农村东部城隍庙内。为县级文物保护单位。历史沿革：清属宁海县南乡西洞庄。
1950年8月，由琴江乡分设健跳乡，属健跳乡。
1951年分建为团结、爱国、民主、和平、互助5个村。
1954年分别成立爱国、民主2个农业初级社和健跳渔业初级社。
1956年合并转为健跳高级社。
1961年10月分设健农、健渔2个大队，属健跳人民公社。
1983年10月，称健农村民委员会，属健跳镇。
