以南浦河过村得名。清光绪《定海厅志˙岱山图》始见地名记载。
2023年3月，南浦村入选浙江省第三批未来乡村创建村名单。
2022年11月，南浦村被确定为2021年度全国综合减灾示范社区。
2019年12月，2019年度浙江省美丽乡村特色精品村名单公布，南浦村榜上有名。
南浦村是岱山县高亭镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为330921100239，居民身份证号码前6位为330921。邮政编码为316000，长途电话区号为580 ，车牌号码为浙L。南浦村与大峧村、塘墩村、板井潭村、黄官泥岙村、大峧山村、江南村、官山村、山外社区、东海村、小蒲门村、大蒲门村、闸口二村、闸口一村、大岙二村相邻。历史沿革：1934年于此设南浦乡，1935年并入中和乡。
1953～1956年复属石马乡。
1958年设南浦大队，属岱中公社。
1984年撤队改设村民委员会。
2016年并入机场社区村民委员会。
2019年析设为南浦村村民委员会。
