相传古时此地瘟疫四起，人丁锐减，后来附近长一灵芝仙草，驱瘟神，救人命，因此称为芝村。旧时芝村庙内有楹联云：“芝草醴泉龙渊有玉，村前庙后船只似云”，两联首字合之即为“芝村”，故名。

芝村村：位于桐乡市西南部，全村面积5.2平方公里，20个村民小组，农户1099户，人口4552人。芝村村与联丰村、上市村、芦母村、景卫村、南阳村、御驾桥村、语溪社区、中山社区、崇德社区、华光村、留良村、新桥村、湾里村、李家坝村相邻。荣誉排行：

2023年3月，芝村村被认定为2022年度“浙江省善治村”。

2022年10月，2022年淘宝村名单发布，芝村村上榜。

2021年12月，芝村村被命名为2021年浙江省卫生村。

2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝村名单，芝村村榜上有名。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝村，芝村村榜上有名。

元宝亭遗址元宝亭遗址位于桐乡市崇福镇芝村村元宝亭小组北，年代为良渚文化至汉，类别为古遗址。2010年9月14日，元宝亭遗址被公布为桐乡市文物保护单位。历史沿革：芝村村解放前属芝村乡。

解放初为芝村乡六村、七村和八村。

1956年为芝村乡联益高级社和群力高级社。

1958年为大麻人民公社十一大队。

2001年10月，四乡合并为崇福镇芝村村。