为村里有六水汇聚而始称“六源”，明嘉靖年间，六源有五秀才携一书童进京赶考，结果六人均中了进士，故名六科村，意为六人科举及第，六科还有一个美丽的名字叫“鹿巢”意为野鹿群集，村委会驻地六科。
2022年1月，入选浙江省2021年度省级“民主法治村（社区）”名单。
六科村是瑞安市湖岭镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为330381122350，居民身份证号码前6位为330381。邮政编码为325000，长途电话区号为577 ，车牌号码为浙C。六科村与鹿中村、金子山村、贾岙村、繁湖社区、四古山村、大岭垟村、永乐村、大河村、汇川村、巾仙溪村、鹿阳村、鹿源村、前坑村、鹿东村相邻。历史沿革：1949年称六科乡第一村。
1961年称永安公社六科大队。
1984年置六科村委会，属永安乡。
2011年撤销永安乡，随乡并入湖岭镇至今。
