据明永乐六年，山西迁民至此定居，村后有莲花山，山上长满棠林，故称。

棠棣埠村位于燕子埠镇最南部310国道与棠台路交汇处，东西分别与车夫山镇、贾汪区汴塘镇交界，辖东棠棣埠、西棠棣埠两个自然村，十个村民小组，总面积3平方公里，耕地面积5638亩，全村社会人口3456人，其中党员52人。棠棣埠村与黑山村、佛头村、小吴村、花山子村、韩寺村、茅寺村、扒头山村、徐洼村、陈黄楼村、鹿寨村、刘官庄村、尤村村、大吴村、郭庄村相邻。荣誉排行：

2021年7月，棠棣埠村西棠棣埠被列入第四批江苏省传统村落名录。

九里莲花山墓群九里莲花山墓群位于邳州市燕子埠镇南6 公里棠棣埠村北100 米。山西坡有黎明滑石厂，山为土石山，在山坡处被当地居民开垦为农耕地。在山顶部及山坡处有汉土坑竖穴墓多座，出土有陶器、铜器、铜钱等文历史沿革：1949年属山东，1953年划入邳县，1958年公社化称东棠棣埠大队和西棠棣埠大队。

1983年称东、西棠棣埠村民委员会。

2001年村级区划调整两村合并为棠棣埠村民委员会至今。