据该村的龙王庙（该庙已经被拆毁）内所存的铁钟铭文记载：清代以前，该村原名为齐洪村。后来因为汾河水泛滥成灾将该村冲为三个自然村，村名改为齐南杜。以后村民们把南面的一块称为南齐村。

南齐村是文水县下曲镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为141121105213，居民身份证号码前6位为141121。邮政编码为033000，长途电话区号为358 ，车牌号码为晋J。南齐村与青高村、北齐村、南贤村、杜村村、朱家堡村、北辛店村、梁家堡村、南辛店村、石家堡村、田家堡村、徐家镇村、忠义村、石永村、永乐村相邻。历史沿革：1949年10月至1953年5月属于文水二区管辖，1953年6月至1958属于南齐乡管辖。

1958年至1960属于巨流公社管辖，1961年至1984年4月属于南齐公社，1984年5月至2001年属南齐乡人民政府管理，1984年生产大队改为村民委员会。

2001年撤乡并镇后属下曲镇人民政府管辖，沿用至今。