因村村土地肥沃，适于种菜，产品销于右玉城，又居右玉城南，故名南园。后将园简化为元。为其村民委员会驻地，故名。

2023年11月，山西省爱国卫生运动委员会命名南元村为2023-2025年山西省卫生村。

2020年8月，山西省爱国卫生运动委员会命名南元村为2020—2022周期山西省卫生村。

南元村是右玉县右卫镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140623101210，居民身份证号码前6位为140623。邮政编码为036000，长途电话区号为349 ，车牌号码为晋F。南元村与黑流堡村、八里庄村、北元村、三里庄村、头水泉村、杀虎口村、李家堡村、红旗口村、下元村、马营河村、乌林村、北草场村、联兴村、翰林社区相邻。历史沿革：1949年解放初属一区新庙乡。

1953年属一区西窑沟乡，称南元行政村。

1956年撤区划乡，属西窑沟乡，并建立农业生产合作社，称南元农业生产合作社。

1958年4月成立人民公社，属西窑沟人民公社，和五里台自然村，称南元大队。

1958年9月建立大人民公社，属长城人民公社（驻地右玉城）仍称大队。

1958年左云、右玉两县合并，属左云县长城人民公社（驻地右玉城）南元大队。

1961年分设右玉县，属右玉县城关人民+查看详细南元村历史沿革>>