隋唐年间，故县镇为铜鞮县治，该村位于城南，得名南庄。因村委会驻地此村，故名。

南庄村位于故县镇西南约三公里处，全村70多户村民，240余口人，有耕地近700亩。在唐高宗年间，大唐著名宰相杜如晦的后辈们因获罪被流放。因杜如晦年轻时曾在现在的故县镇官窝山上向大儒王通求学，于是他的子孙便搬到了故县镇南的一条小山沟中居住。在此开荒种地，耕作劳动，世代繁衍。因当时他们居住的这个小村庄是故县镇往南唯一的一个村庄，所以被人们称作“南庄”。随着故县镇人口的增多，镇南面的村庄也越来越多，但南庄这个村名却未有过更改，并延用至今。南庄村与清河村、连家庄村、下清河村、新尧科村、得胜沟村、安仁村、牛庄村、郭庄村、连家沟村、东仁村、马连道村、北集村、徐村村、神头村相邻。历史沿革：1949年属沁县第二区。

1961年属故县人民公社，南庄生产大队。

1984年4月撤销故县人民公社，设故县镇人民政府，南庄生产大队改为南庄村村民委员会，名称沿用至今。