据查，明朝永乐年间建村。当时，村南是20座联窑，窑口对着村，取名为窑子口。民国二十年分为三个村，该村吴姓多，故取名吴家院。
吴院村位于盘古东南方向京杭运河西侧，南接王黄马，北邻苏院。全村共有324户，农业人口1778人，耕地面积2338亩，村庄占地289亩。村民大多从事第一、二产业，以粮食种植、运输等为主，村内机箱制造业较为发达。吴院村与苏院村、和睦庄村、王黄马村、李营村、西王营村、东王营村、孙家楼村、小盘古村、大盘古村、塔寺庄村、四沃头村、堤下头村、大兴庄村、白庄子村相邻。荣誉排行：
2023年9月，河北省爱卫办命名吴院村为2022年度河北省卫生村。
