因辖区内秦祁河而得名，相传此地曾为秦王朝集结兵力之要地，故名。
秦祁乡地处甘肃省渭源县北部，西北与临洮和定西两县接壤，距渭源县城40公里，距定临公路19.8公里，定渭公路15公里。境内地势西北高，东南低，山多沟深，东西长18公里，南北宽17公里，地域面积115.95平方公里,最高海拔(岗家岔山顶)2585米，年平均气温5℃，年降水量420毫米,降水量分布不均匀,主要集中在秋季,土壤瘠薄，植被稀少，林木面积仅为14228亩，水土流失严重，水质咸苦，境内有秦祁河穿过，秦祁乡以此河而得名。 全乡有11个行政村，64个村民小组，总人口10586人，耕地面积40600亩，人均耕地面积４亩，多数是山旱地。粮食作物主要种植小麦、小豆、洋芋、糜谷、莜麦、扁豆、燕+查看详细秦祁乡概况>>
2024年3月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名秦祁乡为2023年度甘肃省卫生乡镇（街道）。
历史沿革：1949年9月以前，属渭北镇。
1958年12月撤销渭源县时，并入北寨公社。
1962年12月恢复渭源县后，设秦祁公社。
