此地明朝为戍军、垦田屯粮之所，因修建粮仓而得名“大仓”。

大仓镇地处巍山坝子北部，位于东经100°11′～100°15′、北纬25°26′～25°27′之间。东与大理市凤仪镇和弥渡县红岩乡接壤，南与庙街镇相连，西与马鞍山乡毗邻，北与永建镇相接。镇人民政府驻地大仓村委会上厂街，南距县城22千米，北距州府大理市28千米。行政中心所在地海拔1 750米。1954年与永建镇合并成立永建回族自治县，为县政府所在地。1961年10月撤销永建回族自治县并入巍山彝族回族自治县，改称大仓公社。1984年改称大仓区，1988改称大仓乡，1996年2月1日经云南省人民政府批准撤乡建镇。大仓镇总面积174.1平方千米，耕地面积2 468公顷，其中水田1 65+查看详细大仓镇概况>>

2021年11月，被命名为巍山县2021届县级文明村镇。

2014年7月，大仓镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。

垅圩图山城址垅圩图山城址位于巍山县城西北十五公里，在今大仓镇甸中村委会，团山村西面垅圩图山山顶的一块大平地上。遗址后依大黑山，前临阳瓜江，山环水抱，易守难攻，地势险要，站在山顶眺望，整个巍山坝子尽收眼底山龙山于图城遗址该古城遗址距县城15公里，在今大仓镇甸中村公所团山村西面的山龙山于图山山顶的一块大平地上，前临阳瓜江（今大西河），后依大黑山，可望蒙舍川（今巍山坝子）全境，山环水抱，地势险要。根据从元代至清崔文藻故居崔文藻故居位于巍山县大仓镇，年代为民国，类别为近现代建筑。为县级文物保护单位。有食村文昌宫有食村文昌宫位于巍山县大仓镇，年代为清，类别为古建筑。为县级文物保护单位。团山寺团山寺位于巍山县大仓镇，年代为清，类别为古建筑。为县级文物保护单位。+查看更多大仓镇文化旅游景点>>

历史沿革：1954年，与永建镇合并为永建回族自治县。

1961年10月，永建回族自治县并入巍山彝族回族自治县，改称大仓公社。

1996年2月1日，撤乡建大仓镇。