因传说此地有一座庙宇，系很早以前由马、曹两姓人合建，庙正门上原横嵌“马曹庙”三个大字。由于此地为交通要道，后来人们在此开设店铺，逐渐形成集镇，故名。

马曹庙镇隶属湖北省黄冈市团风县。版图面积52.04平方公里。耕地面积1．7万亩，其中水田1.5万亩；山林面积2.4万亩，水面面积O.5万亩；辖21个行政村,181个村民小组，2个居民小组，293个自然村；总户数5907户,其中非农户561户；总人口19830人，其中非农业人口1243人；农村劳动力8859人，其中女劳动力4084人。马曹庙镇地理环境优越。属滨江平原向山区过渡的低丘陵地形；位于东经115°00’07”一115°02’06”，北纬30°38’49”一30°40’03”；海拔最高点为352米，最低点为29米。属亚热带季风气候，其基本特点是：四季分明，日照充足，雨量充沛。多年平均气+查看详细马曹庙镇概况>>

2023年8月，农业农村部、财政部发布首批国家农业产业强镇名单，马曹庙镇（水稻）榜上有名。

2021年2月，湖北省环境保护委员会命名马曹庙镇为2020年度湖北省省级生态乡镇。

2020年8月，马曹庙镇被湖北省交通运输厅评为2019年度湖北省四好农村路示范乡镇。

2019年7月，马曹庙镇入选2019年全国农业产业强镇建设名单。

方本仁庄园方本仁庄园位于团风县马曹庙镇戴家湾村，是鄂东保存最完整的地主庄园，属省级文物保护单位。庄园始建于1927年,1929年完工，占地面积23.8亩,建筑面积2.8亩,是民国时期独具特色的庄园建筑历史沿革：春秋时期，马曹庙镇境域属楚地。

隋开皇十八年（598年）后，属黄冈县。

1949年，属黄冈县第一、第三区。

1951年，分属黄冈县五、六、七区。

1952年，分属回龙山、宋坳、方高坪区。

1975年，团风区的薛坳公社和总路咀的百福寺、马曹庙公社合并成立马曹庙公社。

方本仁（1880～1951），号耀庭。马曹庙镇薛坳戴家塆人。其祖父原住黄州长圻蓼，因常遭水害，搬至百福寺方家道，租种佃田。方幼时入私塾读书12年，继为塾师。一次，因原塾师替人写状纸告他家，遂与之发生争