清朝宣统年间，高姓居民在此建有楼房数栋，故名高楼。
高楼镇地处苏皖两省交界处,是灵璧县东北的边陲乡镇,镇政府所在地高楼集距灵城41公里,总面积95平方公里耕地面积8.1万亩,境内地势东北高西南低,孟山是全镇最高点,海拔51.2米,潼河由西北向东南横贯全境,大小路、鲍虞路、高渔路交叉穿过，交通十分便利。
潼郡遗址潼郡遗址位于灵璧县高楼镇潼郡村，年代为北齐—宋。类别为古遗址。为县级文物保护单位。历史沿革：1949年10月设高楼区至1955年12月。
1958年9月，撤区设立高楼人民公社。
1979年12月再次恢复高楼区建制，辖高楼、卓海、张营、孟山、沙滩、大庙6个公社。
1984年4月，取消人民公社建制，恢复高楼乡，同年9月改为高楼镇。
1992年2月，撤区并乡，将原高楼、卓海、张营、孟山和大庙乡的张刘村合并设立高楼镇。
