该地山沟内适宜种植种菜籽，村落处菜籽沟内，故名。
2024年2月，菜籽沟村被确定为2024年度新疆维吾尔自治区乡村振兴示范村建设名单。
菜籽沟村是木垒哈萨克自治县英格堡乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为652328200204，居民身份证号码前6位为652328。邮政编码为831100，长途电话区号为994 ，车牌号码为新B。菜籽沟村与月亮地村、庙尔沟村、马场窝子村、街街子村相邻。历史沿革：1950年建政时为西宁区菜籽沟乡所辖；1954年后为西吉尔区菜籽沟乡所辖；1956年后为西吉尔区英格堡乡所辖；1958年9月后属红旗公社二大队；1973年后改称菜籽沟大队所属；1984年12月后属英格堡乡菜籽沟村村民委会。
