据当地村民口述，以前有姓巨的人家在这里居住，选择靠山沟以挖窑洞为主居住，故名。
巨沟村是镇原县武沟乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为621027208207，居民身份证号码前6位为621027。邮政编码为745000，长途电话区号为0934 ，车牌号码为甘M。巨沟村与椿岔村、惠大庄村、渠口村、武沟村、张岘村、冯俭村、孟庄村相邻。历史沿革：1958年9月成立巨沟生产大队，属开边公社，管辖8个生产队；1961年6月属黑渠口公社；1970年12月属武沟公社；1983年12月称巨沟村，成立巨沟村村民委员会，属武沟乡政府管辖至今。
