即以花海镇农业灌溉的南水渠而得名。
2021年12月，甘肃省爱卫会命名南渠村为2021年度甘肃省卫生村（社区）。
南渠村是玉门市花海镇下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为620981103200，居民身份证号码前6位为620981。邮政编码为735000，长途电话区号为937 ，车牌号码为甘F。南渠村与黄水桥村、和政社区、中渠村、西泉村、金湾村相邻。历史沿革：1958年9月花海公社成立后村级为生产大队，1983年3月撤销人民公社，成立花海乡，同时，在村级建立了农民群众自治组织村民委员会，取代了原来的生产大队，村民委员会下设村民小组，村民小组取代了原来的生产队。
2004年合村并组，将南渠村、条湖村合并为南渠村，设南渠村村委会。
