因区域内有地片大南山而得名。“南山”从县城华藏寺自西向东有一条通往松山、干城和景泰宁夏方向的道路，因该地位于道路南面，故称南山。

华藏寺镇南山村距天祝县城4公里，辖达家窑、半截沟、边墙沟、马圈湾台、何家台五个村民小组，全村农业人口501户1799人，其中少数民族人口1460人。村党支部现有党员48名，其中女党员4名，少数民族党员30名，高中以上学历党员18名。2019年底实现整村脱贫。南山村主导产业重点以种养殖及劳务输转为主，有种养殖专业合作社14个，种植油菜2400亩、小麦250亩，大田蔬菜263亩。年内输转劳动力430余人。优化产业结构，提高群众收入。争取帮扶单位市国土资源局土地整理项目资金580万元，平整土地2100亩，并配套了高效节水水利设施。改“零碎小田”为“连片大田”，实现集约化发展；改“低效益旱田”+查看详细南山村概况>>

2021年12月，甘肃省爱卫会命名南山村为2021年度甘肃省卫生村（社区）。

历史沿革：解放前属于永登县镇武乡，解放初为天祝区第九乡，1958年为岔口驿大队南山生产队，1961年为南山大队属于岔口驿公社，1962年属于华南公社，1970年属于岔口驿公社，1983年南山村属华藏区华南乡，1985年为南山村属于华藏寺镇管辖至今。