元代期间形成村落，位于一沟壑南边，期许村民永远安居乐业。

2026年8月，被认定为陕西省第三批“千万工程”示范村。

2023年12月，南永宁村被命名为2023年度陕西省省级卫生村。

南永宁村是合阳县金峪镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为610524112208，居民身份证号码前6位为610524。邮政编码为714000，长途电话区号为913 ，车牌号码为陕E。南永宁村与北永宁村、雁村村、白家寨村、沟北村、浪后村、坊庄村、黑镇社区、陈峪村、尧头社区、念吉社区、解庄社区、拔丁社区、背河社区、皇甫庄社区相邻。历史沿革："1969年行政区划调整时新增为南永宁大队，1967年""文化大革命""中更名为红星大队，1969年恢复为原村名，1984年体制改革时改为南永宁村民委员会。