此地境内的水沟旁有一座碾压粮食的水磨坊，故名。
磨子沟村是木里县倮波乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为513422217203，居民身份证号码前6位为513422。邮政编码为615800，长途电话区号为834 ，车牌号码为川W。磨子沟村与陇东村、瓦岗村、龙卧洞村、干海子村相邻。历史沿革：1953年建村归倮波乡成立磨子沟村村民委员会，名称沿用至今。
