五里店地处古驿道九塘和十塘的中点（即五里处，一塘为十里），明万历年间（1563-1620）曾设店铺于此，故名。

2021年12月，入选第一至十届桂林市文明村镇复核通过保留命名名单。

2019年12月，五里店村入选第一批国家森林乡村名单。

五里店村是阳朔县白沙镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为450321101214，居民身份证号码前6位为450321。邮政编码为541000，长途电话区号为773 ，车牌号码为桂C。五里店村与扶龙村、插花桥村、古板村、都林村、蔡村村、大竹山村、蕉芭林村、石塘村、立龙村、白面山村、遇龙村、观桥村、白沙村、白沙街社区相邻。历史沿革：1950年称五里店村，属第一区。

1958年改大队，属白沙公社。

1968年复改五里店大队，属白沙公社。

1984年改五里店村，设立五里店村民委员会，属于白沙镇。

1995年复设五里店村民委员会。