因该村1958年属龙窝公社水南大队水口自然村，1961年从水南大队分出，以水口村起名水口大队，由水墩公社管辖，故名。

2024年3月，水口村被命名为2023年广东省卫生村。

水口村是紫金县水墩镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为441621114210，居民身份证号码前6位为441621。邮政编码为517400，长途电话区号为762 ，车牌号码为粤P。水口村与陂湖村、黄輋村、黎坑村、雅布村、段布村、秋溪村、群丰村、水墩村、上璜坑村、水墩社区相邻。历史沿革：1958年属龙窝人民公社水南大队；1961年龙窝公社水口大队；1963年，水墩公社，水口大队；1983年，撤社设区，水口大队改为水口乡；1987年为水口村委会；1989年，水口乡改为水口管理区；1999年撤销管理区，设立水口村委会，沿用至今。