相传明崇祯七年（公元1634年）前建村，分居东、南、西门，后因南门人多，统称南门。

南门村史属镇一个僻偏，接近南门水库北部距离镇5公里，全村有7个自然村，总户数558户，总人口3210人，全村耕地面积2455亩，其中水田1900亩，旱地550亩，全村耕地面积种植水稻、西瓜、冬瓜、各茨等经济作物。南门村与双墩村、日中社区、九龙村、茅陂村、谷兜村、新平村、坑口村、平东村、大塘村相邻。南门村联系电话：0660-6666208

2023年5月，广东省爱卫会授予南门村2022年广东省卫生村称号。

2019年12月，国家林业和草原局公布第二批国家森林乡村名单，南门村榜上有名。

黄甘岭古道南门村委是黄甘岭古道的必经之路，黄甘岭古道走向为：黄羌镇上头洋，经平东镇谷兜村委黄甘岭、华照楼村、谷兜村、嶂下村，至平东镇南门村委上新村、南门村、桥头村、九菜坑村，再到陆河县龙须径，全长13南门吊涧南门吊涧位于平东镇南门村南门水库副坝口约50米处，是明代军屯时所开凿的水利工程灌溉石渠。“南门吊涧”位于南门峡谷悬崖峭壁，横亘石渠，瀑泉飞泻，是一道长约200余米的石渠，悬空架设在30米高的历史沿革：清光绪年间立“长兴围村”，后十三个村统称为“南门约”。

1950年属海丰建政二区平东乡。

1958年属公平公社日中大队。

1975年由平东公社日中大队析出，设南门大队。

1987年改为平东镇南门村委会。

1989改为南门管理区办事处。

1998年复设为南门村委会，一直沿用至今。