因旧时村前有一段深水河流而得名。

2022年8月，深水村被确定为2022年广东省民主法治示范村（社区）创建单位。

2019年10月，深水村入选2019年广东省卫生村名录。

2019年9月，深水村上榜2018年广东省“民主法治示范村（社区）”创建单位名单。

深水村是高州市马贵镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为440981121208，居民身份证号码前6位为440981。邮政编码为525000，长途电话区号为668 ，车牌号码为粤K。深水村与马贵村、大西村、朗练村、河木垌村、埕垌村、周坑村、马坑村、甘埇村、六塘村、垭垌村、龙坑村、厚元村、山心村、马贵社区相邻。历史沿革：1962年分为马贵人民公社时，命名为深水大队，1983年改为深水管理区，1983年改为深水乡，1986年改为深水农村管理区，1999年后改为深水村委会，沿用至今。