因村域内有磨山而得名磨山村，由磨山社、磨山大队变迁而来。磨山因其石质坚硬，凿制成的石磨品质优良而得名。
2025年12月，被列入湖北省第一批传统村落名录。
2021年2月，湖北省环境保护委员会命名磨山村为2020年度湖北省省级生态村。
磨山村是孝昌县王店镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为420921104205，居民身份证号码前6位为420921。邮政编码为432000，长途电话区号为712 ，车牌号码为鄂K。磨山村与农光村、流砦村、王河村、白鹤村、北新村、河龙村、贺家村、盛畈村、王店社区、庙下村、高岗村、草塘村、官塘村、红胜村相邻。历史沿革：1949年属孝感县王店区王店乡；1955年合作化为磨山社；1958年成立人民公社，为王店公社磨山大队；1975年撤区并社，为王店公社磨山大队；1984年恢复区、乡建制，为王店区磨山村；1987年撤区并乡，为王店镇磨山村；1993年孝昌建县，为孝昌县王店镇磨山村。
2018年合村调整，磨山村、农光村合并为磨山村村民委员会。
