明代，村东有一座寺庙，又因全村为吕姓，故名吕古寺。
吕古寺村是鹿邑县张店镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411628110219，居民身份证号码前6位为411628。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。吕古寺村与魏口村、许庄村、李大楼村、贾庄村、罗庄村、西谢楼村、东谢楼村、杜集村、孙渡口村、赵庄村、乱丝庙村、洼于村、虎杨村、白杨村相邻。历史沿革：1947年前属国民党鹿邑县第八区。
1958年为试量人民公社吕古寺大队。
1975年为张店人民公社吕古寺大队。
1983年改称吕古寺村民委员会，属张店乡。
