陈氏先祖于明初由河南省太康县瓦子村迁此定居，并开设住宿店，又因离城五里，故名五里店。
2021年1月，河南省爱卫会命名五里店村为2020年度河南省卫生村。
五里店村是扶沟县帛亭街道下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为411621004213，居民身份证号码前6位为411621。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。五里店村与前谢村、后张村、后谢村、赵沟村、前许村、八里营村、后许村、马村村、张庄村、拐王村、庞庄村、罗沟村、丁庄村相邻。历史沿革：清代属扶沟县西街地方。
民国年间属扶沟县中区（城关关帝庙）。
1949年属扶沟县一区（城关）。
1958年设五里店大队属城关公社。
1983年改为五里店村民委员会，属城郊乡。
