明代吕、赵、黄三姓由山西省洪洞县迁此建村，得名吕家滩。明万历年间，吕家户户都挖有鱼塘，水潭星罗棋布，正式定名吕潭。清咸丰年间修寨，又名“保和寨”，寨墙周长6公里，原贾鲁河穿寨而过，水陆交通便利，是扶沟首镇，和朱仙镇，周家口齐名。因村落面积较大，人口较多，1951年把原吕潭村划分为三，此村定名为吕潭三村。
吕三村是扶沟县吕潭乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411621203228，居民身份证号码前6位为411621。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。吕三村与吕二村、关营村、吕一村、西吉庄村、范岗村、高台村、葛岗村、宋寨村、吉唐庄村、齐村村、金岗尾村、曹庄村、杨湾村、栾坡村相邻。历史沿革：清代属扶沟县吕北地方。
民国年间属扶沟县三区（吕潭）。
1994年设立吕潭三村村民委员会，属吕潭乡。
