元末余思铭守金刚台与元朝分庭抗礼，元军征剿金刚台，相混战中，余思铭与其子分散，后来又在此相遇，合力拼杀，方才脱身，得名遇子店，“遇”、“余”谐音，成今名。
余子店村是商城县伏山乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411524209205，居民身份证号码前6位为411524。邮政编码为464000，长途电话区号为376 ，车牌号码为豫S。余子店村与鲍冲村、里罗城村、徐堰村、七里山村、燕湾村、杨桥村、枫香树村、石冲村、毛坪河村、大木厂村、南冲村、千金山村、龙泉村、龙井河村相邻。历史沿革：1941年属太枫乡第八保。
1958年建余子店大队，属东风公社。
1983年改为余子店村民委员会，属伏山乡。
