清初，曹姓迁此建村设店，故名。
2023年9月，曹店村被确定为河南省第一批乡村建设示范村。
曹店村是平桥区肖店乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411503207203，居民身份证号码前6位为411503。邮政编码为464000，长途电话区号为376 ，车牌号码为豫S。曹店村与赵庄村、高寨村、三台村、庞湾村、齐营村、肖店街社区、刘台村、邱湾村、张湾村、元庄村、左营村、左庙村相邻。历史沿革：1949年属洋河区肖店乡。
1958年建高庄大队，属国庆公社。
1983年改曹店村民委员会，属肖店乡至今。
