据《读史方舆卷十六》记载，唐大历年间于东三里古城设县城，传此地盖有大片粮仓，人称粮囤，宋因水患迁移，粮仓随移。洪武二十一年（1388）有马姓从山西洪洞县迁来落户，取村名囤上，后因村庄壮大，又分前、后囤上，因在后，取名后囤上。

后囤上村是清丰县古城乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410922205220，居民身份证号码前6位为410922。邮政编码为457000，长途电话区号为393 ，车牌号码为豫J。后囤上村与董村村、前囤上村、西王庄村、大高村、齐家村、吴家村、梁村村、徐家庄村、吕家村、临河村、马庄村、后张六村、前张六村、叶村村相邻。历史沿革：民国时期属清丰县西北区。

1940年，抗日民主政权建立后，属卫河县第三区。

1949年，设立平原省撤销卫河县，属平原省清丰县第五区。

1952年，撤销平原省，属河南省清丰县第五区。

1958年，为清丰县古城人民公社后囤上大队。

1984年，体制改革，为后囤上村民委员会。