明初。于姓的一世祖于永城到此开店，形成村名永城店。后人认为以祖先名字作村名不雅，在民国初改称于家店。渐简称于店。1949年按其方位分为南、北于店。居南，称南于店。
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2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝村名单，南于店村榜上有名。
南于店村是新乡县朗公庙镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410721104206，居民身份证号码前6位为410721。邮政编码为453000，长途电话区号为373 ，车牌号码为豫G。南于店村与贺堤村、北于店村、朗北街村、王府庄村、朗中街村、永安村、东荆楼村、朗南街村、西荆楼村、前庄村、原庄村、后庄村、毛庄村、东马头王村相邻。历史沿革：1958年称南于店大队，属朗公庙人民公社。
1983年更名为南于店村民委员会，属朗公庙乡。
