肖姓最早迁此，旧时与周围其它村统称“小寨”。建国后改村名“小寨”为“肖寨”。1993年2月纠正为“小寨”。

2023年9月，小寨村被确定为河南省第一批乡村建设示范村。

2021年1月，河南省爱卫会命名小寨村为2020年度河南省卫生村。

小寨村是荥阳市刘河镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410182108204，居民身份证号码前6位为410182。邮政编码为450000，长途电话区号为371 ，车牌号码为豫A。小寨村与反坡村、徐沟村、申庄村、庵上村、陈家岗村、官顶村、架子沟村、刘河村、王河村、石庄村、分水岭村、任洼村、窝张村、花河村相邻。历史沿革：1958年9月建肖寨大队，大队部驻肖寨得名，属刘河人民公社，11月并入崔庙人民公社。

1961年划归上街区，初属肖寨人民公社，次年归增置的上街区米河公社，不久属复置的肖寨公社。

1964年复归荥阳县，属崔庙人民公社。

1983年因体制改革，肖寨大队变更为肖寨村民委员会，属刘河乡。

1993年更名为小寨村民委员会。