明代末年，村内仅住几户人家，荒草丛生，经常有狼出没。村民为保生活平安，在此建有两座山神庙，村以庙名。

2022年1月，山神庙村被命名定为2021年度河南省卫生村。

山神庙村是巩义市站街镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410181106228，居民身份证号码前6位为410181。邮政编码为450000，长途电话区号为371 ，车牌号码为豫A。山神庙村与岳岭村、东站镇村、柏茂村、胡坡村、巴沟村、鲁村村、寺沟村、北瑶湾村、黑叶沟村、南瑶湾村、驻驾河村、小黄冶村、集沟村、王沟村相邻。历史沿革：1948年4月前为大新乡第三保山神庙，后属第五区（城关区）。

1959年属城关公社新沟大队。

1961年为城关区新沟公社山神庙大队。

1963年为城关公社山神庙大队。

1983年公社改镇，为站街镇山神庙村，同年设立山神庙村民委员会。