村位于旧县城之南门，得名“南门村”。

南门村是莲花县琴亭镇下辖的行政村，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为360321101201，居民身份证号码前6位为360321。邮政编码为337000，长途电话区号为799 ，车牌号码为赣J。南门村与西门村、北门村、明珠社区、西边村、城南社区、莲花村、花塘村、御景湾社区、永安社区、寨里村、金城社区、白马村、斜田村、幸福村相邻。历史沿革：中华人民共和国成立初属城镇乡第一区；1956年3月撤区并乡，谓城乡镇农业高级合作社，1958年8月底，并社转人民公社，谓琴水人民公社五一大队；1982年改为南门大队，直属琴水公社管辖。

1984年3月，为琴亭镇南门村村民委员会。

1992年8月，莲花县划归萍乡市，属萍乡市莲花县琴亭镇南门村村民委员会至今。