因村子建在有野芹菜的溪畔，故名。

芹溪村位于吉巷乡里半区，距乡政府7公里。全村由两个自然村组成，共有16个村民小组，229户，1304人。全村共有党员38名，其中预备党员3名。全村耕地面积2000亩，林地面积6790亩。2011年农民人均收入达到5200元。芹溪村充分发挥当地的气候土壤优势，大力发展以水果和食用菌为主的经济类农作物种植业，全村水蜜桃和油柰的种植面积达1600亩，年产值90万元，黑木耳年产量50万筒，产值200万元。在此基础上，村两委积极探索农产品的深加工前景，计划通过各种优惠措施吸引农产品深加工企业进村落户，以此提高农村品的附加值，进一步提高农民收入，为村民创造更多的就地就业机会。在村貌建设方面+查看详细芹溪村概况>>

2021年11月，福建省爱卫办命名芹溪村为2021年福建省卫生村。

历史沿革：1949年设芹溪区芹溪乡，1958年为吉巷公社芹溪大队，1984年改为吉巷乡芹溪村委会。