先祖是璧洲人，从峡下沿下莒溪而上，原名为上莒。1974年由峡下大队划出改名为小莒，以示区别。

2024年1月，被命名为2023年度龙岩市“平安村居（社区）”。

2023年1月，被命名为2022年度龙岩市“平安村居（社区）”。

2021年11月，福建省爱卫办命名小莒村为2021年福建省卫生村。

2021年8月，被确定为连城县第十四届（2018-2020年度）县级文明村镇（社区）。

2021年1月，被命名为2020年度龙岩市“平安村居（社区）”。

小莒村是连城县莒溪镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为350825104205，居民身份证号码前6位为350825。邮政编码为364000，长途电话区号为597 ，车牌号码为闽F。小莒村与詹坑村、墩坑村、莒莲村、墙里村、莒市村、后埔村、吴坑村、隔口村、溪源村、乐地村、厦庄村、陈地村、厦地村、高地村相邻。历史沿革：宋属河源下里，明、清属河源里，1949年前属三民乡壁西保，1955年合作化时划属莒莲，1958年属莒溪公社峡下大队，1970年由莒莲划出为峡下大队，1984年改名为小莒村委会，1993年属莒溪镇小莒村，至今沿用。

下辖:小莒、峡下、凹头片、大墘上、杨梅坪、秀墘6个自然村。