原来，此处有条小街，街东边有个深水潭，潭中有块磨状的石头，又因村委会驻地，故得名。

磨子潭村位于县城东南51公里处，磨子潭镇政府所在地。2002年县民政局在磨子潭镇开展并村试点时，由原金家冲村和磨子潭村合并而成。东部与单龙寺乡东风桥村毗邻，南接本镇白水畈村，西与本镇宋家河村相连，北与本镇龙井冲村相接。总面积18.3平方公里，现有山场2.5万亩，水面2000亩，耕地900亩，茶园784亩，板栗1130亩，毛竹1300亩。下辖桃树坳、黑凹、何家院、龙井河、小河、干塘湾、石槽、后街、大湾、溢洪道、佛子岭、黄家湾、油芳岭、阴排、阳排、观音庵、老鸭畈、小岭、戴家冲、五七、金家冲、北风坳、白水口等23个村民组，656户2524人。磨子潭电站、磨子潭中学坐落其中；东太公路、318省道及商景+查看详细磨子潭村概况>>

2022年1月，磨子潭村被命名为2021年度安徽省森林村庄。

历史沿革：原属磨子潭乡，1958年乡改公社属磨子潭公社；1983年公社改乡属属磨子潭乡；1985年1月改乡改镇属属磨子潭镇。

2002年村级规模调整时原金家冲村、磨子潭两村合并新建磨子潭村。