因村委会驻地大马寨，故名。2006年10月村级规模调整时撤销大马寨、贺寨、葛王三村委会并称今名。

肖口镇马寨村位于肖口集西侧，太临路穿境而过，地处平原，土壤肥沃，资源丰富，该村于2006年10月由贺寨、葛王、马寨等3个行政村合并而成，总面积4平方公里，辖11个自然村，50个村民组，1890户，人口为7466人，耕地面积为7004亩，下设12个党小组，现有党员112名。马寨村与钱庄村、王寨村、田庄村、邢小街村、毛庄村、陈庙村、新王村、肖口村相邻。荣誉排行：

2020年7月，马寨村入选第六届阜阳市文明村。

历史沿革：1958年属于肖口人民公社，原名马寨大队，1981年避重名更名大马寨大队，1983年属于肖口乡，1992年属于肖口镇，2006年10月村级规模调整时撤销大马寨（1994年撤销西何庄村委会并入）、贺寨、葛王三村委会并称今名。