查当地《郑氏宗谱》，宋朝，郑先顺于某年某月朔夜，梦见龙绕独山，遂取名“龙角珠山”。后以其村处于悬立的小山旁，而改名独山。
2023年3月，独山村被认定为2022年度“浙江省善治示范村”。
独山村是三门县珠岙镇下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为331022102243，居民身份证号码前6位为331022。邮政编码为318000，长途电话区号为576 ，车牌号码为浙J。独山村与高枧村、双楼村、香山村、梅坑村、竹墩村、岭里村、娄坑村、桐岩李村、岭口村、珠萃屏村、东谢村、下洋村、桥下村、樟树下村相邻。历史沿革：清属宁海县仙岩乡四十一都一图，后改属宁海县西乡石马庄。
民国29年（1940）三门建县前后，均属高枧乡。
民国36年（1947）3月改属高吴乡。
1958年冬改称独山生产队，属高枧管理区。
1962年改称独山大队，属高枧人民公社。
1983年称独山村民委员会，属高枧乡。
