据传此地原属海边，饮水困难，先人在村前挖河饮水，形成水仓，故称其地为水仓头，村以此得名，故名。
2021年12月，水仓头村被命名为2021年浙江省卫生村。
水仓头村是椒江区下陈街道下辖的行政村，城乡分类代码为112，为城乡结合区。区划代码为331002006236，居民身份证号码前6位为331002。邮政编码为318000，长途电话区号为576 ，车牌号码为浙J。水仓头村与勇进村、永胜村、南门村、草坦洪村、广兴村、水陡王村、南野份村、前阮村、明星村、横塘村、三顶桥村、两爿墩村、杨家村、高张村相邻。历史沿革：1951年属下陈乡，称第十八村。
1956年合作化时与甲头合并，建立和平社。
1961年为和平大队，因重名，1981年更名为水仓头大队。
1983年体制改革时为黄岩县三甲区下陈乡水仓头村。
1992年撤扩并后为椒江市下陈镇水仓头村。
1994年撤地建市后为椒江区下陈镇水仓头村。
2001年为椒江区下陈街道水仓头村。
