因原属万良公社，主要村落南侧濒海得名。
万南村是岱山县衢山镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为330921106254，居民身份证号码前6位为330921。邮政编码为316000，长途电话区号为580 ，车牌号码为浙L。万南村与沙塘村、樟木山村、黄沙村、石子门村、马足村、凉峙村、打水村、沼潭村、乍浦门村、万北村、田涂村、涨网套村、东岙村、渔耕碗村相邻。历史沿革：1949年属乍门乡第七保；1950年解放初属乍门乡第七村；1956年属万良乡衢二渔业社；1958年属衢山公社乍门管理区万良渔业大队；1961年成立万良公社后，万良大队划分为万南、万北两个大队；1984年万南大队改建为万南村，属万良乡。
2001年撤销万良乡，归属衢山镇。
